La institución fue fundada por el reverendo padre Luis Eduardo Rendón Rendón el 23 de abril de 1960 de naturaleza privada (parroquial) y de carácter mixto.
La secretaria de Educación, le otorgó licencia de funcionamiento por resolución N°95 de octubre 27 de 1961 y su carácter de director general al reverendo Luis Eduardo Rendón Rendón.
Identificado con el Nombre de María Auxiliadora en la consideración de que el reverendo padre como religioso escogió un símbolo protector de la comunidad cristiana.
-Educación Básica Secundaria: aprobado por resolución N° 1554 de abril 23 de 1970
-se departamentalizo por decreto 775 de noviembre 28 de 1980.
-Se crearon los grados 10° y 11° de educación media por decreto 094 de febrero 27 de 1986. Aprobado por resolución N° 8225 de julio 31 de 1986 hasta el 31 de julio de 1989.
La planta de personal docente y administrativo es pagada en su totalidad por recursos propios del departamento, un rector, 16 docentes, una Secretaria, una bibliotecaria, un portero, dos celadores, una auxiliar de servicios generales. Hasta el año 1997.
El rector Fredy Enrique López Paba fue nombrado en 1982.
En 1986 nombraron una trabajadora social, un docente en el área de educación Física, en ciencias Sociales, tecnóloga en educación artística.
1986, fue la primera promoción de bachilleres del colegio.
1997, fueron suspendidos por el departamento los nombramientos del personal administrativo, que fueron remplazados por un celador nocturno, aseadora, secretaria nombrada por el municipio,
1999 fueron declarados insubsistentes los docentes de doble vinculación, el rector y dos Docentes que fueron remplazados por un rector encargado, el director de núcleo Jorge Alfonso Charry, y trasladado el profesor Douglas Gutiérrez de la nómina F.E.R. por el profesor del área de matemática.
En el año 2000 fue trasladada la profesora del área de religión Gema del Carmen Arrieta Charry sin nombrar remplazo.
En el año 2000 fueron incorporados al situado fiscal los docentes Guillermo González Lascarro, Samuel Alfonso Sierra Cuello, en el 2001 nombrada rectora encargada Magdalena Arenas Arenas.
En este año reubicaron en el colegio tres (3) docentes decretados pagados por el municipio, a Jesusita Catalán Rojas, Alba López Martínez y Leodys Coronado Acuña como Coordinadora.
En este año comenzó la organización de la fusión de la primaria con el bachillerato, teniendo coordinador académico, Edith Maria Sánchez Cano, Coordinador de Disciplina Leodys Coronado Acuña.
La planta física es de propiedad del municipio.
En el año 2001 queda una nómina de 25 docentes del Colegio Maria Auxiliadora. En el mes de octubre fue trasladado el profesor Samuel Sierra Cuello al Colegio Agropecuario como coordinador.
En el año 2004 Según Decreto 162 de abril 15 la institución Educativa Maria Auxiliadora, tendrá como rectora en propiedad a la Lic. Leodys Coronado Acuña.